Useful Links

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Total List (136)

Proteome/Metabolome (27)

Genome/Transcriptome (10)

Portal/Literature (9)

Link Board


Proteome/Metabolome protein-protein interaction을 볼 수 있는 사이트 정리	Visit : 3

2018/02/05

**1. https://omictools.com/protein-protein-interaction-prediction-category
- protein-protein interaction을 볼 수 있는 여러가지 사이트를 종합하여 올린 사이트입니다.

2. http://cb.csail.mit.edu/cb/struct2net/webserver/

3. http://www.compbio.dundee.ac.uk/www-pips/

**4. http://mips.helmholtz-muenchen.de/proj/ppi/
- 다른 PPI resources도 참고로 포함되어 있습니다.

*5. https://string-db.org
- 많이 사용되는 사이트입니다.

*6. https://www.ebi.ac.uk/intact/
- STRING처럼 많이 사용되는 사이트입니다.

7. https://thebiogrid.org
- 특정 protein의 binding proteins를 찾을 수 있습니다.

8. http://www.hitpredict.org/
-Protein-protein interactions from IntAct, BioGRID, MINT, DIP, MatrixDB, InnateDB are combined, annotated and scored. The reliability score is calculated based on the experimental details of each interaction and the sequence, structure and functional annotations of the interacting proteins.

2023.12.08


Company DUB assay Kit	Visit : 0

http://www.promega.com/products/drug-discovery/protease-assays/dub_glo-protease-assay/

2012/11/10

DUB assay Kit 파는곳


Proteome/Metabolome human에 있어 ubiquitination 되는 단백질들	Visit : 1

2018/10/06

http://bioinfo.bjmu.edu.cn/hubi/


Proteome/Metabolome IntAact	Visit : 1

http://www.ebi.ac.uk/intact/

2013/11/29

Bioinformatics site : Finding your protein substrates


Others Knockout mouse project	Visit : 0

https://www.komp.org/

2013/12/03

Knockout mouse 관련 product 검색


Portal/Literature NC3Rs	Visit : 1

http://www.nc3rs.org.uk/category.asp?catID=8

2013/12/03

모든 mouse관련 정보를 찾을 수 있는 포털사이트


Journal 논문 IF 검색을 위한 약어 검색 사이트	Visit : 0

http://jabbr.mannlib.cornell.edu/

2013/12/16

코넬대의 논문 약어 검색 링크


Genome/Transcriptome p53 Luciferase Reporter Stable Cell Lines	Visit : 0

http://www.signosisinc.com/product/Luciferase_Reporter_Stable_Cell_Lines#376

2014/03/20

p53 Luciferase Reporter Stable Cell Line을 파는 곳.


Utility 이용가능한 Ubiquitination prediction tool	Visit : 14

2014/10/02

이미 link 되어있던 사이트 중 사용가능한 사이트와 새로 추가된 사이트의 주소를 link 합니다. ( 2023년 08월 18일)

http://www.ubpred.org (작동안됨)

http://csb.cse.yzu.edu.tw/UbiSite/ (작동안됨)

http://bdmpub.biocuckoo.org/prediction.php

http://202.195.183.4:8000/mUbiSiDa.php (작동안됨)(reprod.njmu.edu.cn/mUbiSiDa)

http://www.jci-bioinfo.cn/iUbiq-Lys (작동안됨)

http://protein.bio.unipd.it/rubi/

http://chemdp.com/ubipredictor.php (작동안됨)

http://csb.cse.yzu.edu.tw/UbiNet/(작동안됨)

http://omictools.com/ubiquitination-sites-category (작동안됨)

http://protein.cau.edu.cn/cksaap_ubsite (작동안됨)

http://bioinfo.ncu.edu.cn/ubiprober.aspx (작동안됨)

https://services.healthtech.dtu.dk/services/NetChop-3.1/

http://ubihub.thesgc.org


Utility 특정 protein의 binding partner를 찾을 수 있는 site입니다.	Visit : 1

http://thebiogrid.org/

2016/03/29

http://thebiogrid.org/


Proteome/Metabolome http://www.genome.jp/tools/motif/	Visit : 2

2016/06/08

protein sequence를 넣으면
motif 종류와 설명이 깔끔하게 잘 나와있는 tool입니다.


Genome/Transcriptome OligoAnalyzer	Visit : 0

2016/12/05

기본적인 Tm, GC%와 2ndary structure, self dimer, hetero dimer 등의 여부를 확인할 수 있음

https://sg.idtdna.com/calc/analyzer


Journal Journal Impact factor Search	Visit : 1

http://www.bioxbio.com/if/

2018/12/28

논문 IF 검색 사이트입니다.


Proteome/Metabolome E3 ligase / DUB <-> substrate 찾는 사이트	Visit : 1

2021/01/27

UbiBrowser:
http://ubibrowser.ncpsb.org/ubibrowser/


Journal figure 정리 필요시 tiff file 들을 하나의 파일로 합쳐 줄 수 있는 사이트 입니다	Visit : 0

https://products.aspose.app/pdf/ko/merger/tiff

2020/12/21

https://products.aspose.app/pdf/ko/merger/tiff

한 피규어가 여러 tiff file로 나눠졌을지 그 파일들을 한 파일로 합쳐 주고 페이지가 넘어가도록 할 수 있도록 하는 사이트 입니다


Others PROTAC DB site	Visit : 0

http://cadd.zju.edu.cn/protacdb/

2022/11/08

PROTAC DB 2.0 site

http://cadd.zju.edu.cn/protacdb/

Target protein의 PROTAC 개발 여부와 E3 ligase, warhead 등을 검색을 통해서 알 수 있는 data base site 입니다.

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