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Link Board
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**1. https://omictools.com/protein-protein-interaction-prediction-category
- protein-protein interaction을 볼 수 있는 여러가지 사이트를 종합하여 올린 사이트입니다.
2. http://cb.csail.mit.edu/cb/struct2net/webserver/
3. http://www.compbio.dundee.ac.uk/www-pips/
**4. http://mips.helmholtz-muenchen.de/proj/ppi/
- 다른 PPI resources도 참고로 포함되어 있습니다.
*5. https://string-db.org
- 많이 사용되는 사이트입니다.
*6. https://www.ebi.ac.uk/intact/
- STRING처럼 많이 사용되는 사이트입니다.
7. https://thebiogrid.org
- 특정 protein의 binding proteins를 찾을 수 있습니다.
8. http://www.hitpredict.org/
-Protein-protein interactions from IntAct, BioGRID, MINT, DIP, MatrixDB, InnateDB are combined, annotated and scored. The reliability score is calculated based on the experimental details of each interaction and the sequence, structure and functional annotations of the interacting proteins.
2023.12.08
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protein sequence를 넣으면
motif 종류와 설명이 깔끔하게 잘 나와있는 tool입니다. |
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| Bioinformatics site : Finding your protein substrates |
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| australian proteasome analysis facility |
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| 휴먼과 마우스의 protease genome만을 비교해 놓은 데이타베이스. |
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Peptidase database
우리에게 꼭 필요한 데이타베이스입니다. |
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Protein Protein Interaction Viewer
Protein Interaction 데이타베이스. 일본 RIKEN에서 운영. |
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| 노트르담 대학에서 운영하는 단백질 네트워크 연합 |
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| 타이거에서 운영하는 단백질 분류. 완성도가 좀 떨어지긴 합니다. |
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| yeast 위주의 interaction database 강추! |
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| Protein Fingerprints, 모티프 스캔 |
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| 단백질 분류, 도메인 스캔, HMM 라이브러리 |
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| NCBI에서 제공하는 비교적 간단한 단백질 도메인 스캔 |
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