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Proteome/Metabolome (26)

Genome/Transcriptome (9)

Portal/Literature (9)

Link Board


Proteome/Metabolome protein-protein interaction을 볼 수 있는 사이트 정리	Visit : 1

2018/02/05

**1. https://omictools.com/protein-protein-interaction-prediction-category
- protein-protein interaction을 볼 수 있는 여러가지 사이트를 종합하여 올린 사이트입니다.

2. http://cb.csail.mit.edu/cb/struct2net/webserver/

3. http://www.compbio.dundee.ac.uk/www-pips/

**4. http://mips.helmholtz-muenchen.de/proj/ppi/
- 다른 PPI resources도 참고로 포함되어 있습니다.

*5. https://string-db.org
- 많이 사용되는 사이트입니다.

*6. https://www.ebi.ac.uk/intact/
- STRING처럼 많이 사용되는 사이트입니다.

7. https://thebiogrid.org
- 특정 protein의 binding proteins를 찾을 수 있습니다.


Journal figure 정리 필요시 tiff file 들을 하나의 파일로 합쳐 줄 수 있는 사이트 입니다	Visit : 0

https://products.aspose.app/pdf/ko/merger/tiff

2020/12/21

https://products.aspose.app/pdf/ko/merger/tiff

한 피규어가 여러 tiff file로 나눠졌을지 그 파일들을 한 파일로 합쳐 주고 페이지가 넘어가도록 할 수 있도록 하는 사이트 입니다


Others 논문 Schematic diagram tool	Visit : 0

https://biorender.com/

2020/08/15

https://biorender.com/

- 논문 figure에 들어갈 그림을 그리는 Science Figures
전용 툴입니다.

개인이 각각의 모형을 끌어다가 배치하고 그리기때문에 하나뿐인 그림이 완성 되며 “Created with BioRender.com.” 라는 문구를 통해 citation 하면 논문 figure 로 사용 가능합니다.


Journal Journal Impact factor Search	Visit : 1

http://www.bioxbio.com/if/

2018/12/28

논문 IF 검색 사이트입니다.


Proteome/Metabolome human에 있어 ubiquitination 되는 단백질들	Visit : 1

2018/10/06

http://bioinfo.bjmu.edu.cn/hubi/


Genome/Transcriptome OligoAnalyzer	Visit : 0

2016/12/05

기본적인 Tm, GC%와 2ndary structure, self dimer, hetero dimer 등의 여부를 확인할 수 있음

https://sg.idtdna.com/calc/analyzer


Proteome/Metabolome http://www.genome.jp/tools/motif/	Visit : 2

2016/06/08

protein sequence를 넣으면
motif 종류와 설명이 깔끔하게 잘 나와있는 tool입니다.


Utility 특정 protein의 binding partner를 찾을 수 있는 site입니다.	Visit : 1

http://thebiogrid.org/

2016/03/29

http://thebiogrid.org/


Utility 이용가능한 Ubiquitination prediction tool	Visit : 12

2014/10/02

이미 link 되어있던 사이트 중 사용가능한 사이트와 새로 추가된 사이트의 주소를 link 합니다. (두 개 빼고 다 작동됨: 2020년 1월 21일)

http://www.ubpred.org

http://csb.cse.yzu.edu.tw/UbiSite/

http://bdmpub.biocuckoo.org/prediction.php

http://202.195.183.4:8000/mUbiSiDa.php (reprod.njmu.edu.cn/mUbiSiDa)

http://www.jci-bioinfo.cn/iUbiq-Lys

http://protein.bio.unipd.it/rubi/

http://chemdp.com/ubipredictor.php (작동안됨)

http://csb.cse.yzu.edu.tw/UbiNet/

http://omictools.com/ubiquitination-sites-category

http://protein.cau.edu.cn/cksaap_ubsite (작동안됨)

http://bioinfo.ncu.edu.cn/ubiprober.aspx

http://www.cbs.dtu.dk/services/NetChop/

http://ubihub.thesgc.org


Genome/Transcriptome p53 Luciferase Reporter Stable Cell Lines	Visit : 0

http://www.signosisinc.com/product/Luciferase_Reporter_Stable_Cell_Lines#376

2014/03/20

p53 Luciferase Reporter Stable Cell Line을 파는 곳.


Journal 논문 IF 검색을 위한 약어 검색 사이트	Visit : 0

http://jabbr.mannlib.cornell.edu/

2013/12/16

코넬대의 논문 약어 검색 링크


Portal/Literature NC3Rs	Visit : 1

http://www.nc3rs.org.uk/category.asp?catID=8

2013/12/03

모든 mouse관련 정보를 찾을 수 있는 포털사이트


Others Knockout mouse project	Visit : 0

https://www.komp.org/

2013/12/03

Knockout mouse 관련 product 검색


Proteome/Metabolome IntAact	Visit : 1

http://www.ebi.ac.uk/intact/

2013/11/29

Bioinformatics site : Finding your protein substrates


Company DUB assay Kit	Visit : 0

http://www.promega.com/products/drug-discovery/protease-assays/dub_glo-protease-assay/

2012/11/10

DUB assay Kit 파는곳


Genome/Transcriptome Luciferase promoter product	Visit : 0

http://www.genecopoeia.com/eflyers/us/?utm_source=GeneCopoeia&utm_medium=email&utm_campaign=Un-Luc-May-12&utm_unique=YmFla0BjaGEuYWMua3I%253D%250A

2012/05/16

GeneCopoeia site


Company Reporter assay	Visit : 0

http://genecopoeia.com/product/promoter-reporter-clones/?utm_source=un_pro_1011&utm_medium=email&utm_campaign=20111025&utm_unique=YmFla0BjaGEuYWMua3I%253D%250A

2011/11/01

Reporter assay


Company Rockland	Visit : 2

http://www.rockland-inc.com

2005/09/30

443


Company Abgent	Visit : 2

http://www.abgent.com

2005/09/30

111


Company Bostonbiochem	Visit : 2

http://www.bostonbiochem.com

2005/09/30

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